在成功封印“暗月之匙”及相关黑暗灵能物品后，多元宇宙迎来和平，各维度蓬勃发展，清风寨繁荣依旧。朱无视、素心和逸尘未因荣誉懈怠，于隐秘处闭关修炼，留意宇宙动态。
平静之下，“微光维度”现异常。灵能微光分布紊乱，影响生态，植物生长与生物行为失常。守护者向清风寨求救，朱无视等人即刻前往。踏入该维度，不安气息弥漫，微光闪烁似藏危险。
朱无视运转混沌之力感知，发现异常源于外来神秘力量，虽不同于以往黑暗势力，却扰乱了灵能。素心观察到灵能微光与古老符文有关，符文似被篡改，致灵能失控。逸尘运用空间之力扫描，发现源头指向灵辉圣殿，那是曾遭废弃并封印的灵能核心之地。
众人向灵辉圣殿进发，途中遭遇能量风暴与异化生物攻击。朱无视施“混沌星辰斩”斩碎风暴，素心以精妙剑法应对异化生物，逸尘用空间之力开辟通道并切割生物。
抵达圣殿，大门紧闭且有灵能封印，强行突破恐酿恶果。素心发现类似符文，解读后得知需按序激活符文开门。三人依言操作，大门开启，混乱灵能扑面而来，朱无视施展“混沌星辰护盾”抵挡，众人进入。
圣殿内昏暗，石柱刻满符文图案，中央灵能水晶柱灵能泄漏，一群神秘人围绕其举行仪式。朱无视施“混沌星辰风暴”攻击，神秘人以奇特灵能法术防御。素心施展“心剑合一”冲入敌阵，却遭干扰。逸尘制造空间裂缝，被神秘人化解。
朱无视发现神秘人法术能量循环破绽在水晶柱符文，施“混沌星辰裂”破坏符文，打破防御。三人合力攻击，神秘人纷纷倒地。之后，他们来到水晶柱前，素心施展净化法术，朱无视与逸尘协助，使水晶柱恢复正常，“微光维度”灵能微光与生态渐稳。
但朱无视等人未放松警惕，分析后认为神秘人来自“灵影教派”，此教派曾妄图掌控灵能，后被击败隐匿，此次或为卷土重来。
朱无视回清风寨与各维度代表商讨对策。决定科技维度扫描教派踪迹，神秘学维度研究破解法术并加固防护，朱无视等人带领特别行动小组寻找并歼灭其据点。
依据线索，众人来到“幽森维度”，此处森林茂密、雾气弥漫。踏入后，潮湿阴森气息袭来，雾气限制视线，朱无视以混沌之力形成光晕照明并抵御雾气。前行中，队员发现异常能量波动，众人靠近后发现隐藏在树林的古老建筑，周边布满符文陷阱。
众人准备突破时，建筑防御启动，灵能光束射来，朱无视施“混沌星辰护盾”抵挡，决定强攻。朱无视施“混沌星辰风暴”，素心以“心剑合一”刺向大门，逸尘用空间之力瓦解防御，却发现防御与雾气能量关联。
逸尘用空间符文干扰雾气能量，朱无视准备致命一击，素心等人警惕守护。雾气能量紊乱，建筑防御动摇，朱无视施“混沌星辰破”，成功攻破城墙，众人进入。
建筑内阴暗潮湿，通道刻满符文图案。深入后遇“灵影教派”成员，双方展开战斗。朱无视发现成员灵能武器攻击后有破绽，提醒众人抓住时机，经苦战击败敌人。
继续深入到大厅，中央灵能水晶球光芒奇异，教派高层正举行仪式。朱无视等人准备攻击，老者察觉，称计划将成，挥动法杖催动水晶球，强大灵能袭来，朱无视施护盾抵挡。
朱无视认为法杖是关键，与素心、逸尘集中攻击。朱无视施“混沌星辰裂”，素心施“心剑合一”终极剑法，逸尘施展空间压缩法术，合力击碎法杖。老者惨叫，实力大减，朱无视趁机刺伤老者。
解决老者后，朱无视等人准备研究水晶球秘密，此时建筑外震动，无数神秘生物涌出包围建筑。朱无视喊道需守住建筑并破解水晶球秘密。